html текст
All interests
  • All interests
  • Design
  • Food
  • Gadgets
  • Humor
  • News
  • Photo
  • Travel
  • Video
Click to see the next recommended page
Like it
Don't like
Add to Favorites

Не можем повторить

Авторы амбициозного проекта по проверке воспроизводимости онкологических научных исследований на этой неделе сообщили, что вместо запланированных 50 работ они проверят всего 18. Потратив пять лет и примерно миллион долларов, ученые выяснили, что качественно воспроизвести биологические эксперименты гораздо сложнее, чем кажется.

Воспроизводимость, то есть возможность повторить научный эксперимент в другой лаборатории и получить те же результаты, принципиально важна для любой экспериментальной науки: так мы узнаем, что авторы не взяли свои выводы из головы и не получили их из-за какой-то ошибки или случайности в протоколе, следовательно, на основе этих выводов можно продолжать научную работу. В идеале воспроизвести, и не один раз, нужно любое исследование, но на практике это довольно трудно и дорого — ежегодно в мире выходит более миллиона научных статей, многие из которых описывают сложные и даже многолетние эксперименты. 

Более того, воспроизведение чужих работ, несмотря на всю его нужность, — до сих пор неблагодарное дело: мало кто захочет ставить на паузу собственные оригинальные исследования, чтобы потратить очень много времени и ресурсов на проверку чужих, которая, к тому же, может не дать никакого вразумительного результата (и публиковать будет нечего, а гонку за статьями никто не отменял). В современной академической культуре воспроизведение экспериментов — это, скажем так, не сексуально: часто ли вы видите на N + 1 новости о том, что кто-то успешно повторил чужое исследование? (Зато для безуспешных попыток у нас есть целый блог!)

Помимо абстрактного дискомфорта по поводу добра, справедливости и научного метода, беда с воспроизведением и воспроизводимостью научных работ может иметь и очень конкретные последствия. В науке этот феномен часто обозначается словами garbage in, garbage out, «мусор на входе — мусор на выходе»: если вы, скажем, пытаетесь создать эффективное и безопасное лекарство от какой-нибудь важной болезни, используя данные некачественного исследования (которое никто не проверил), у вас, очевидно, ничего не получится, и много денег на разработку этого лекарства вы потратите впустую. В 2012 году биофармацевтическая корпорация Amgen сообщила, что ее специалистам удалось воспроизвести лишь шесть из 53 высокоцитируемых научных работ по онкологии. За год до этого другая компания, Bayer, не смогла воспроизвести 79 процентов, или 53 из 67 отобранных ею медицинских экспериментов. Ни Amgen, ни Bayer не раскрыли список работ, которые не получилось воспроизвести, но осадок от таких новостей остался очень серьезный.

Проект Reproducibility Project: Cancer Biology (RP:CB) стартовал в 2012 году, а год спустя, в октябре 2013 года, получил от благотворительного фонда Лауры и Джона Арнольдов грант в 1,3 миллиона долларов. Его организаторы, впечатлившись проблемами фармкомпаний, задумали воспроизвести 50 наиболее значимых научных экспериментов в области биологии рака, опубликованных в Science, Nature, Cell и других ведущих научных журналах в 2010–2012 годах. Предполагалось, что исследования будут повторять сторонние лаборатории, найденные через стартап Science Exchange, своеобразную биржу экспериментальных площадок, а на весь проект уйдет около года. Публиковать результаты в открытом доступе собирался журнал PLOS ONE.

В то время проект RP:CB встретил разную реакцию. Часть ученых приветствовала попытку воспроизвести ключевые исследования в рамках открытого и прозрачного проекта, в то время как авторы многих работ предупреждали, что такая попытка заранее обречена на неудачу из-за недостаточной квалификации специалистов лабораторий, которым достанутся исследования, и сложности многих экспериментов. Тем не менее, как писала тогда пресса, авторы исследований в основной массе подключились к проекту, помогая его организаторам восстановить детали экспериментальных протоколов, не вошедшие в итоговые публикации.

Проект довольно быстро столкнулся со сложностями: например, оказалось, что информации в статьях бывает настолько мало, что иногда у авторов исходных работ приходилось узнавать, сколько именно животных они использовали для экспериментов. К концу 2015 года проект понизил планку до 37 исследований, ссылаясь на недостаток финансирования, а к январю 2017 года, одновременно с итогами воспроизведения первых пяти работ — до 29 исследований.

«Я бы хотел, чтобы мы воспроизвели больше работ. Но в некотором смысле мы не до конца понимали, насколько это сложно, пока не взялись за сам проект», — сказал журналу Science руководитель проекта Тим Эррингтон из Центра открытой науки.

Как пишет Science, в последние несколько месяцев ученые решили приостановить 11 экспериментов и сосредоточиться на оставшихся 18, 10 из которых уже завершены. В итоге, по словам идеолога проекта и соосновательницы Science Exchange Элизабет Иорнс, вместо 26 тысяч долларов одно воспроизведенное исследование обошлось в среднем в 60 тысяч (две работы, которые Иорнс не называет, обошлись существенно дороже).

По словам Эррингтона, очень много времени уходило на то, чтобы решать мелкие проблемы с экспериментальными методами и находить или воссоздавать нужные реагенты, клеточные линии и другие необходимые элементы опыта. Все это по-хорошему должно попадать в исходную статью и публиковаться на специальных открытых площадках типа библиотеки плазмид Addgene, чтобы облегчать задачу тем, кто пытается воспроизвести или продолжить конкретную работу, считает ученый.

Результаты 10 готовых попыток воспроизведения опубликованы в журнале eLife: пять работ в целом удалось воспроизвести, две — нет (зато это удалось сделать другим научным группам вне рамок проекта), еще три попытки не дали однозначного результата. Сейчас команда RP:CB заканчивает оставшиеся восемь статей и готовит обобщение-метаанализ для всего проекта. Детали 11 незавершенных экспериментов тоже будут опубликованы, обещает Эррингтон.

Ольга Добровидова

Читать дальше
Twitter
Одноклассники
Мой Мир

материал с nplus1.ru

1

      Add

      You can create thematic collections and keep, for instance, all recipes in one place so you will never lose them.

      No images found
      Previous Next 0 / 0
      500
      • Advertisement
      • Animals
      • Architecture
      • Art
      • Auto
      • Aviation
      • Books
      • Cartoons
      • Celebrities
      • Children
      • Culture
      • Design
      • Economics
      • Education
      • Entertainment
      • Fashion
      • Fitness
      • Food
      • Gadgets
      • Games
      • Health
      • History
      • Hobby
      • Humor
      • Interior
      • Moto
      • Movies
      • Music
      • Nature
      • News
      • Photo
      • Pictures
      • Politics
      • Psychology
      • Science
      • Society
      • Sport
      • Technology
      • Travel
      • Video
      • Weapons
      • Web
      • Work
        Submit
        Valid formats are JPG, PNG, GIF.
        Not more than 5 Мb, please.
        30
        surfingbird.ru/site/
        RSS format guidelines
        500
        • Advertisement
        • Animals
        • Architecture
        • Art
        • Auto
        • Aviation
        • Books
        • Cartoons
        • Celebrities
        • Children
        • Culture
        • Design
        • Economics
        • Education
        • Entertainment
        • Fashion
        • Fitness
        • Food
        • Gadgets
        • Games
        • Health
        • History
        • Hobby
        • Humor
        • Interior
        • Moto
        • Movies
        • Music
        • Nature
        • News
        • Photo
        • Pictures
        • Politics
        • Psychology
        • Science
        • Society
        • Sport
        • Technology
        • Travel
        • Video
        • Weapons
        • Web
        • Work

          Submit

          Thank you! Wait for moderation.

          Тебе это не нравится?

          You can block the domain, tag, user or channel, and we'll stop recommend it to you. You can always unblock them in your settings.

          • nplus1.ru
          • ученые
          • исследования
          • эксперименты
          • биология
          • домен nplus1.ru

          Get a link

          Спасибо, твоя жалоба принята.

          Log on to Surfingbird

          Recover
          Sign up

          or

          Welcome to Surfingbird.com!

          You'll find thousands of interesting pages, photos, and videos inside.
          Join!

          • Personal
            recommendations

          • Stash
            interesting and useful stuff

          • Anywhere,
            anytime

          Do we already know you? Login or restore the password.

          Close

          Add to collection

             

            Facebook

            Ваш профиль на рассмотрении, обновите страницу через несколько секунд

            Facebook

            К сожалению, вы не попадаете под условия акции