html текст
All interests
  • All interests
  • Design
  • Food
  • Gadgets
  • Humor
  • News
  • Photo
  • Travel
  • Video
Click to see the next recommended page
Like it
Don't like
Add to Favorites

Сборка геномов

Биолог Сергей Науменко о технологии высокопроизводительного секвенирования, структуре генома и графовом подходе
Как работает технология высокопроизводительного секвенирования? Почему возникает задача сборки геномов? Какие проблемы возникают в процессе ее решения? Об этом рассказывает научный сотрудник лаборатории эволюционной геномики ФББ МГУ имени М.В. Ломоносова Сергей Науменко.

Чтобы получать тексты геномов, используется технология, которая называется «высокопроизводительное секвенирование». Берется образец ткани определенного организма, из этого образца выделяется ДНК, специальным образом подготавливается библиотека, и высокопроизводительный секвенатор за время, равное двум неделям, прочитывает весь генотип данного образца.

Геном любого организма содержит огромное количество повторов. В некоторых растениях более 50% генома — это повторы. Когда вы складываете строки обратно, возникает ситуация неоднозначного сложения. Кроме того, геномы очень большие. Геном человека — это 3,5 миллиарда нуклеотидов. Бывают растения с геномом до 20 миллиардов нуклеотидов. Недавно шведские ученые просеквенировали геном ели: из 20 миллиардов нуклеотидов у них получилось собрать около 4 миллиардов, хотя они занимались этим несколько лет.

В будущем, несомненно, размер фрагмента ДНК, прочитанного секвенатором, будет расти. Это, скорее всего, сделает подход, основанный на маленьких подстроках, уже неприменимым. Этот подход использовался в те времена, когда размер чтения был еще меньше — около 30 нуклеотидов.

Сергей Науменко

научный сотрудник лаборатории эволюционной геномики факультета биоинженерии и информатики МГУ им. Ломоносова

Все материалы автора

Читать дальше
Twitter
Одноклассники
Мой Мир

материал с postnauka.ru

6

      Add

      You can create thematic collections and keep, for instance, all recipes in one place so you will never lose them.

      No images found
      Previous Next 0 / 0
      500
      • Advertisement
      • Animals
      • Architecture
      • Art
      • Auto
      • Aviation
      • Books
      • Cartoons
      • Celebrities
      • Children
      • Culture
      • Design
      • Economics
      • Education
      • Entertainment
      • Fashion
      • Fitness
      • Food
      • Gadgets
      • Games
      • Health
      • History
      • Hobby
      • Humor
      • Interior
      • Moto
      • Movies
      • Music
      • Nature
      • News
      • Photo
      • Pictures
      • Politics
      • Psychology
      • Science
      • Society
      • Sport
      • Technology
      • Travel
      • Video
      • Weapons
      • Web
      • Work
        Submit
        Valid formats are JPG, PNG, GIF.
        Not more than 5 Мb, please.
        30
        surfingbird.ru/site/
        RSS format guidelines
        500
        • Advertisement
        • Animals
        • Architecture
        • Art
        • Auto
        • Aviation
        • Books
        • Cartoons
        • Celebrities
        • Children
        • Culture
        • Design
        • Economics
        • Education
        • Entertainment
        • Fashion
        • Fitness
        • Food
        • Gadgets
        • Games
        • Health
        • History
        • Hobby
        • Humor
        • Interior
        • Moto
        • Movies
        • Music
        • Nature
        • News
        • Photo
        • Pictures
        • Politics
        • Psychology
        • Science
        • Society
        • Sport
        • Technology
        • Travel
        • Video
        • Weapons
        • Web
        • Work

          Submit

          Thank you! Wait for moderation.

          Тебе это не нравится?

          You can block the domain, tag, user or channel, and we'll stop recommend it to you. You can always unblock them in your settings.

          • PostNauka
          • ученые
          • растения
          • мгу
          • youtube
          • геном
          • домен postnauka.ru

          Get a link

          Спасибо, твоя жалоба принята.

          Log on to Surfingbird

          Recover
          Sign up

          or

          Welcome to Surfingbird.com!

          You'll find thousands of interesting pages, photos, and videos inside.
          Join!

          • Personal
            recommendations

          • Stash
            interesting and useful stuff

          • Anywhere,
            anytime

          Do we already know you? Login or restore the password.

          Close

          Add to collection

             

            Facebook

            Ваш профиль на рассмотрении, обновите страницу через несколько секунд

            Facebook

            К сожалению, вы не попадаете под условия акции