html текст
All interests
  • All interests
  • Design
  • Food
  • Gadgets
  • Humor
  • News
  • Photo
  • Travel
  • Video
Click to see the next recommended page
Like it
Don't like
Add to Favorites

CCDC22 и воспаление

 Наша лаборатория выпустила новую статью. Тема статьи настолько узко-специфична - речь там о молекулярке воспаления - что рассказывать о ней не имеет смысла. Тем не менее, рассказать можно историю о том, как эта работа получилась.

Белок CCDC22 привлек наше внимание после того, как он независимо всплывал в различных масс-спеках - он оказался общим кофактором для 10 разных белков, с которыми мы работаем (мой шеф получил эту лабораторию, открыв группу из 10 гомологичных белков - COMMD1-COMMD10). Беда в том, что функции ни COMMD белков, ни тем более CCDC22 почти не известны - первые служат адапторами для убиквитинилирования, а второй имел только имя.



Стандарная рутинная работа - оверэкспрессия белков и сиРНК нокауты - показали что таки да, CCDC22 тоже принимает участие как адаптор в убиквитинилировании IkB белка - регулятора воспаления. Однако дальше этого факта, довольно туманного по своей природе, пойти не удалось - ведь вся работа велась на клетках, сиРНК к CCDC22 довольно токсичны, и размаха работа не получила. Худо-бедно скомпонованная история была отправлена в JBC. Для непосвященных поясню, что в последнее время журнал JBC, некогда довольно сильный, выступает в роли кладбища многообещающих работ: туда шлют все работы, которые застряли на полпути, и опубликовать в приличном журнале их нету шансов.

Однако даже в JBC не пришли в восторг от наших изысканий - мы получили 4 страницы замечаний, выполнять которые не было никакого желания. Работа превратилась бы в висяк, если б не чудесное совпадение - именно в тот момент некие австралийские генетики опубликовали скромный отчет о том, что некий ген CCDC22 однозначно замешан в мозговой деятельности, и мутация в CCDC22 обнаружена у нескольких семей с мозговыми расстройствами (ментальная ретардация, есть такая болезнь). Причем кроме мощного генетического изучения (геномные сиквенсы и прочее) статья абсолютно провисала по молекулярной линии - была предпринята вялая попытка биоинформатически предложить роль CCDC22, но мимо.

Мы связались с австралийцами - мол, мы знаем  молекулярные функции CCDC22, давайте дружить и сотрудничать. Австралийцы радостно согласились - они на тот момент исчерпали тему, и собирались ее забросить. Все что нам нужно было - немного клеток из пациентов, несущих мутацию в CCDC22 - будь-то кровь или фибробласты. У них - о чудо! - оказалось и то, и другое, причем уже иммортализированные.

Через пару месяцев мы получили первые клетки, быстро провели те же тесты, что уже делали на клеточных линиях - и поняли, что мы попали пальцем в небо - все эффекты, наблюдаемые ранее в искусственных системах, повторялись в клетках больных. Запахло жаренным!

Тут  стоит обратить внимание, что работать с австралийцами довольно тяжело из-за того, что ритм работы в США и ритм работы в Австралии абсолютно разный. Они расслабленны и приятны в общении - и получить ответ на свое письмо через неделю или две - обычное дело. Это бесило моих коллег - я же был вакцинирован опытом общения с украинскими и русскими "академегами", поэтому выступал своего рода переводчиком. Как пример - нам пришлось отложить публикацию почти на месяц, т.к. один из австралийских соавторов не мог подписать электронное соглашение с журналом (нажать онлайн кнопочку Yes), т.к. был в отпуске. Почему так - я не знаю, не спрашивайте - просто люди действительно более релаксированны, наверное это хорошо для нервов.

Постепенно тема развилась - с нами связались еще и немецкие генетики, которые также исследовали некоторые мутанты данного белка у ментально больных. Мы перепроверили и включили данные по их мутантам также.

И вот наступил момент истины - по нашим данным, мутации в CCDC22 далжны вызывать неслабые проблемы с иммунитетом - на молекулярном уровне мы это видели четко. Мы снова связались с австралийцами - посмотрите истории болезней всех семей с синдромом, и выпишите нам в столбик все инфекционные болезни, которыми они болели. После это история была бы закончена - от молекулярки до человека, статья отлично подходила для Nature Immunology. Потекли недели ожидания (австралийские генетики должны были связаться с австралийскими лечащими врачами - никто из нас не ожидал, что на это уйдет меньше месяца).

Когда пришел ответ - мы его сначала не восприняли серьезно. Что значит - "нет"? Как может 15 человек за всю жизнь не иметь ни одного инфекционного заболевания? Герпес на губе, прыщи, кашель утром - да что угодно, неужели не было никогда? Ответ - нет, не задокументированно. Прощай, Nature, - иммунного фенотипа нет.

Тем не менее, статья уже была готова, результаты сходились - махнули мы рукой на Nature, чай не в последний раз. Статья на удивление легко прошла - только одна ревизия, при чем довольно мягкая. Чего вам всем и желаю в будущем!

P.S. Когда статья уже печаталась, с нами связался доктор из Австралии - у старшего появились симптомы серьезного инфекционного заболевания. А позавчера мы познакомились с другим американским доктором - у него пациент с дупликацией гена CCDC22 никак не может справится с простыми вирусами - постоянные высыпания на коже. Значит, наша история вела к правильным выводам - но менять уже что-то поздно, да и лень. Ведь мы начали уже изучать способы коррекции последствий этой мутации.

Читать дальше
Twitter
Одноклассники
Мой Мир

материал с livejournal.com

8

      Add

      You can create thematic collections and keep, for instance, all recipes in one place so you will never lose them.

      No images found
      Previous Next 0 / 0
      500
      • Advertisement
      • Animals
      • Architecture
      • Art
      • Auto
      • Aviation
      • Books
      • Cartoons
      • Celebrities
      • Children
      • Culture
      • Design
      • Economics
      • Education
      • Entertainment
      • Fashion
      • Fitness
      • Food
      • Gadgets
      • Games
      • Health
      • History
      • Hobby
      • Humor
      • Interior
      • Moto
      • Movies
      • Music
      • Nature
      • News
      • Photo
      • Pictures
      • Politics
      • Psychology
      • Science
      • Society
      • Sport
      • Technology
      • Travel
      • Video
      • Weapons
      • Web
      • Work
        Submit
        Valid formats are JPG, PNG, GIF.
        Not more than 5 Мb, please.
        30
        surfingbird.ru/site/
        RSS format guidelines
        500
        • Advertisement
        • Animals
        • Architecture
        • Art
        • Auto
        • Aviation
        • Books
        • Cartoons
        • Celebrities
        • Children
        • Culture
        • Design
        • Economics
        • Education
        • Entertainment
        • Fashion
        • Fitness
        • Food
        • Gadgets
        • Games
        • Health
        • History
        • Hobby
        • Humor
        • Interior
        • Moto
        • Movies
        • Music
        • Nature
        • News
        • Photo
        • Pictures
        • Politics
        • Psychology
        • Science
        • Society
        • Sport
        • Technology
        • Travel
        • Video
        • Weapons
        • Web
        • Work

          Submit

          Thank you! Wait for moderation.

          Тебе это не нравится?

          You can block the domain, tag, user or channel, and we'll stop recommend it to you. You can always unblock them in your settings.

          • biomolecula
          • домен imbg.livejournal.com
          • домен livejournal.com

          Get a link

          Спасибо, твоя жалоба принята.

          Log on to Surfingbird

          Recover
          Sign up

          or

          Welcome to Surfingbird.com!

          You'll find thousands of interesting pages, photos, and videos inside.
          Join!

          • Personal
            recommendations

          • Stash
            interesting and useful stuff

          • Anywhere,
            anytime

          Do we already know you? Login or restore the password.

          Close

          Add to collection

             

            Facebook

            Ваш профиль на рассмотрении, обновите страницу через несколько секунд

            Facebook

            К сожалению, вы не попадаете под условия акции