html текст
All interests
  • All interests
  • Design
  • Food
  • Gadgets
  • Humor
  • News
  • Photo
  • Travel
  • Video
Click to see the next recommended page
Like it
Don't like
Add to Favorites

Биологи построили 3D-модель генома мыши


Наложение пяти моделей структуры генома одной из исследуемой клеток

T.J. Stevens et al. / Nature, 2017

Международная группа ученых получила трехмерную модель генома мыши. Данные, на которых она основана, получены от одиночных клеток, а не от целого образца ткани. Работа опубликована в журнале Nature.

Известно, что в развернутом состоянии ДНК имеет достаточно большую длину, и уместить весь геном в ядро клетки в таком виде было бы весьма затруднительно. Поэтому ДНК плотно упакована, но при этом активно «работающие» участки генома поддерживаются в раскрытом состоянии. «Знание того, как расположены гены и регуляторные элементы в заданный момент времени, поможет понять молекулярные механизмы контроля и поддержания их экспрессии» — говорит Эрнест Лауэ, главный автор исследования.

Чтобы увидеть укладку ДНК с высоким разрешением, исследователи из Кембриджского Университета и Института Стволовых Клеток Wellcome Trust—MRC использовали одновременно два подхода. Они взяли восемь эмбриональных стволовых клеток мыши и сначала получили микрофотографии их ядер со сверхвысоким разрешением. Затем к этим же клеткам применяли метод Hi-C, позволяющий установить, какие участки генома контактируют между собой.

Методика начинается с обработки клеток формальдегидом, который сшивает вместе белки и ДНК, находившиеся рядом в пространстве. Затем в образцы добавляют ферменты, которые разрезают ДНК на маленькие кусочки. При этом фрагменты ДНК, которые взаимодействовали с одной и той же молекулой белка или белковым комплексом, остаются связанными. Прочитав последовательности этих фрагментов, ученые определяют, какие участки генома были сближены в пространстве.

Для восьми клеток, которые исследовались индивидуально, авторы работы получили от 37 до 122 тысяч контактов ДНК. Это cоставляет всего 1,2-4,1 процента всех возможных контактов, однако в сочетании с микрофотографиями дает достаточно информации для получения 3D-модели.


Авторы сравнили структуры геномов разных клеток между собой. Оказалось, что расположение топологически ассоциированных доменов (областей генома, где наблюдается много контактов) и свободных петель значительно варьируют. Однако деление на А и В компартменты (А взаимодействуют в основном с А, В — с В), расположение доменов, связанных с оболочкой ядра, и организация активных регуляторных элементов в разных клетках согласованы. 

Авторы предполагают, что именно согласующиеся характеристики главным образом влияют на структуру каждой хромосомы. Тем не менее, это не единственные факторы, которые ее определяют. В прошлом году группа американских ученых установила, как на изменение трехмерной структуры хроматина влияют эпигенетические метки.

Анна Образцова

Читать дальше
Twitter
Одноклассники
Мой Мир

материал с nplus1.ru

3

      Add

      You can create thematic collections and keep, for instance, all recipes in one place so you will never lose them.

      No images found
      Previous Next 0 / 0
      500
      • Advertisement
      • Animals
      • Architecture
      • Art
      • Auto
      • Aviation
      • Books
      • Cartoons
      • Celebrities
      • Children
      • Culture
      • Design
      • Economics
      • Education
      • Entertainment
      • Fashion
      • Fitness
      • Food
      • Gadgets
      • Games
      • Health
      • History
      • Hobby
      • Humor
      • Interior
      • Moto
      • Movies
      • Music
      • Nature
      • News
      • Photo
      • Pictures
      • Politics
      • Psychology
      • Science
      • Society
      • Sport
      • Technology
      • Travel
      • Video
      • Weapons
      • Web
      • Work
        Submit
        Valid formats are JPG, PNG, GIF.
        Not more than 5 Мb, please.
        30
        surfingbird.ru/site/
        RSS format guidelines
        500
        • Advertisement
        • Animals
        • Architecture
        • Art
        • Auto
        • Aviation
        • Books
        • Cartoons
        • Celebrities
        • Children
        • Culture
        • Design
        • Economics
        • Education
        • Entertainment
        • Fashion
        • Fitness
        • Food
        • Gadgets
        • Games
        • Health
        • History
        • Hobby
        • Humor
        • Interior
        • Moto
        • Movies
        • Music
        • Nature
        • News
        • Photo
        • Pictures
        • Politics
        • Psychology
        • Science
        • Society
        • Sport
        • Technology
        • Travel
        • Video
        • Weapons
        • Web
        • Work

          Submit

          Thank you! Wait for moderation.

          Тебе это не нравится?

          You can block the domain, tag, user or channel, and we'll stop recommend it to you. You can always unblock them in your settings.

          • nplus1.ru
          • ученые
          • университет
          • исследования
          • домен nplus1.ru

          Get a link

          Спасибо, твоя жалоба принята.

          Log on to Surfingbird

          Recover
          Sign up

          or

          Welcome to Surfingbird.com!

          You'll find thousands of interesting pages, photos, and videos inside.
          Join!

          • Personal
            recommendations

          • Stash
            interesting and useful stuff

          • Anywhere,
            anytime

          Do we already know you? Login or restore the password.

          Close

          Add to collection

             

            Facebook

            Ваш профиль на рассмотрении, обновите страницу через несколько секунд

            Facebook

            К сожалению, вы не попадаете под условия акции