html текст
All interests
  • All interests
  • Design
  • Food
  • Gadgets
  • Humor
  • News
  • Photo
  • Travel
  • Video
Click to see the next recommended page
Like it
Don't like
Add to Favorites

Разработан новый метод секвенирования ДНК в метагеномных образцах

Автор: Андрей Васильков 12 декабря 2012

Институтом Сенгера (Великобритания) предложен метод прямого секвенирования малых геномов (бактерий, вирусов) без предварительной стадии подготовки фрагментов анализируемой ДНК. Для определения нуклеотидной последовательности требуется примерно в пятьсот раз меньшее количество ДНК – порядка одного нанограмма.

Метод впервые позволяет выполнять идентификацию микроорганизмов в метагеномных образцах. В эксперименте ещё на стадии апробации прямому секвенированию успешно подверглись одно- и двухцепочечные ДНК различных вирусов, а также сравнительно длинная кольцевая молекула ДНК золотистого стафилококка.

Интерактивный геномный браузер SMRT View – фрагмент окна (иллюстрация: Wellcome Trust Sanger Institute)

Классический метод идентификации микроорганизмов предусматривает отбор проб биологических образцов или смывов с поверхностей. Затем требуется подобрать питательную среду и вырастить колонию. Только после этого можно приступать к выделению ДНК и её секвенированию, если дальнейший анализ предусматривает расшифровку генома.


Колония золотистого стафилококка – увеличение в 5000 раз (фото: Janice Haney Carr/ Jeff Hageman, M.H.S.)

Сама стадия подготовки в классическом варианте занимает минимум 12 часов, в то время как предложенная методика уже сейчас позволяет выполнить весь анализ за 8 часов.

Помимо экономии времени, новый метод даёт возможность выполнять прямой анализ исчезающе малых количеств ДНК. В текущем варианте он ограничен тремя тысячами операциями считывания, поэтому наиболее логичной сферой применения видится экспресс-анализ образцов на содержание различных микроорганизмов.

В случае бактерий отдельный интерес представляет возможность прямого секвенирования плазмидной ДНК, так как с ней связано определение чувствительности к антибиотикам. После оптимизации метода можно будет идентифицировать штамм и прогнозировать его резистентность к лекарственным препаратам в автоматическом режиме.

Читать дальше
Twitter
Одноклассники
Мой Мир

материал с computerra.ru

3

      Add

      You can create thematic collections and keep, for instance, all recipes in one place so you will never lose them.

      No images found
      Previous Next 0 / 0
      500
      • Advertisement
      • Animals
      • Architecture
      • Art
      • Auto
      • Aviation
      • Books
      • Cartoons
      • Celebrities
      • Children
      • Culture
      • Design
      • Economics
      • Education
      • Entertainment
      • Fashion
      • Fitness
      • Food
      • Gadgets
      • Games
      • Health
      • History
      • Hobby
      • Humor
      • Interior
      • Moto
      • Movies
      • Music
      • Nature
      • News
      • Photo
      • Pictures
      • Politics
      • Psychology
      • Science
      • Society
      • Sport
      • Technology
      • Travel
      • Video
      • Weapons
      • Web
      • Work
        Submit
        Valid formats are JPG, PNG, GIF.
        Not more than 5 Мb, please.
        30
        surfingbird.ru/site/
        RSS format guidelines
        500
        • Advertisement
        • Animals
        • Architecture
        • Art
        • Auto
        • Aviation
        • Books
        • Cartoons
        • Celebrities
        • Children
        • Culture
        • Design
        • Economics
        • Education
        • Entertainment
        • Fashion
        • Fitness
        • Food
        • Gadgets
        • Games
        • Health
        • History
        • Hobby
        • Humor
        • Interior
        • Moto
        • Movies
        • Music
        • Nature
        • News
        • Photo
        • Pictures
        • Politics
        • Psychology
        • Science
        • Society
        • Sport
        • Technology
        • Travel
        • Video
        • Weapons
        • Web
        • Work

          Submit

          Thank you! Wait for moderation.

          Тебе это не нравится?

          You can block the domain, tag, user or channel, and we'll stop recommend it to you. You can always unblock them in your settings.

          • computerra.ru
          • домен computerra.ru
          • домен blogs.computerra.ru

          Get a link

          Спасибо, твоя жалоба принята.

          Log on to Surfingbird

          Recover
          Sign up

          or

          Welcome to Surfingbird.com!

          You'll find thousands of interesting pages, photos, and videos inside.
          Join!

          • Personal
            recommendations

          • Stash
            interesting and useful stuff

          • Anywhere,
            anytime

          Do we already know you? Login or restore the password.

          Close

          Add to collection

             

            Facebook

            Ваш профиль на рассмотрении, обновите страницу через несколько секунд

            Facebook

            К сожалению, вы не попадаете под условия акции